２ちゃんねるのスレッドや板を Foxage2ch へ追加するには、ブラウザでスレッドや板を表示中に Foxage2ch の [スレッドや板を追加] ボタンを押してください。スレッドや板が追加されると自動で板（フォルダ）が生成され、その中へスレッドが配置されます。

また、左図のようにブラウザのロケーションバーのアイコンを Foxage2ch のサイドバーまたはウィンドウへドラッグ＆ドロップすることによっても、 Foxage2ch へ追加することができます。同様にリンクをドラッグ＆ドロップして追加することも可能です。
なお、 Foxage2ch のツールバーアイコン上へURLをドラッグオーバーすると、 Foxage2ch のサイドバーまたはウィンドウが開かれる、という便利な裏技もあります。

左図のように [更新チェック] ボタンを押すと、すべての板の更新チェックを行うことができます。更新チェックはスレッドごとではなく、板ごとに行われます。各板のスレッド一覧 (subject.txt) を取得し、レスの数を調べるという仕組みです。
板の更新チェックは上から順に行われます。更新されたスレッドは太字で表示され、自動的にその板の一番上へ移動します。 DAT落ちしたと思われるスレッドはグレーで表示されます。

板（フォルダ）を右クリックして [更新チェック] を行うこともできます。
なお、サーバーへの負担を軽減するため、同じ板の更新チェックは最低1分の間隔を空ける必要があります（同じ板を立て続けに更新チェックしようとすると「あと xx秒待って」というメッセージが表示されます）。

更新されたスレッドを開くには、単純にそのスレッドをクリックすればよいのですが、更新されたスレッドすべてをまとめて開きたいときは左図のように [更新されたスレッドを開く] ボタンを押してください。
なお、この処理ではサーバー／クライアント両者の負担を軽減するため、更新されたスレッドは3秒間隔で順次バックグラウンドのタブで開かれていきます。

各板の更新されたスレッドをまとめて開くには、板（フォルダ）を右クリックして [更新されたスレッドを開く] を選択してください。
ちなみに [更新されたスレッドを開く] の処理中に Foxage2ch のサイドバーを閉じてしまうと、処理が中断されてしまいますので注意してください（更新チェックについても同様）。

板（フォルダ）を右クリックして [新しい区切り] をクリックすると、ツリーへ区切りが挿入されます。
区切りを右クリックして [更新チェック (次の区切りまで)] や [更新されたスレを開く (次の区切りまで)] を選択すると、2つの区切りの間にある板についてのみ更新チェックなどが可能です。
区切りのタイトルは [プロパティ] から変更可能です。

ツリーのスレッドを右クリックして[次スレを探す...]を選択すると、似たような名前のスレッドを探して次スレ候補を一覧表示します。適切な次スレを選択して[完了]ボタンを押すと、次スレがツリーへ追加されます。

ツリーの板を右クリックして[移転ウィザード...]を選択すると、サーバーの移転を検出して新たに板とスレッドをツリーへ追加します。

[bbs2chreader と連携] オプションを有効にすると、スレッドや板は bbs2chreader で開かれます。また、[ツール] → [２ちゃんねる] で、ブラウザに２ちゃんねるのトップページが表示されるのではなく、 bbs2chreader のサイドバーが開かれるようになります。より快適なスレッド閲覧を行うために bbs2chreader をインストールすることをオススメします。
[レスさかのぼり表示差分] たとえば 2 に設定してある場合、300までのレスが既読の状態でスレッドを開くと298から表示されるようになります。

Foxage2ch ツリーのスレッドはドラッグ＆ドロップによる並び替えはできませんが、板（フォルダ）については [板の並び替え] によって並び替えが可能になっています。

OpenJane のお気に入り (favorites.dat) からスレッドのURLをインポートすることができます。インポート処理はかなりゆっくりと行われますので、まったりとお待ちください。